واحد تغذیه مرکز جامع درمان بیماری های خاص در آذرماه 1397 با یک کارشناس تغذیه آغاز به کار کرده است. این واحد کلیه بیماران خاص مراجعه کننده به این مرکز را پوشش میدهد. این بیماری ها شامل همو دیالیز، دیالیز صفاقی، تالاسمی، هموفیلی، پروانه ای، سیستیک فیبروز، MS، SMA، PPH، و بیماران پیوندی می باشد. این واحد همچنین در قالب کلینیک تغذیه مراجعین نابارور و بیماران خارج از مرکز را با تعرفه دولتی ویزیت می کند. کارشناس تغذیه مسئولیت تهیه منو غذایی مخصوص بیماران این مرکز و نظارت بر پخت و توزیع غذا را نیز بر عهده دارد.